孙思邈晚年，对他近百年来积累的大量方剂作了全面整理。在方剂学方面对后世做出巨大贡献。
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孙思邈晚年在隐居五台山期间，开始对他长期积累的大量方剂作全面系统地整理总结。他的方剂内容非常丰富，有来自民间的、宗教界的、外国的，更多的是他自己在长期临床实践中总结创造的方剂。他对所有方剂都要经过无数次的临床验证，有“大验”、“神良”之效的“故录之”。他随时收集验证，随时记录，数十年来，他的零碎记录已有几大捆。这次在五台山，他以极大的精力来整理这些方剂。为了“总摄众病” , “临事处方”，他把方剂类型分为汤剂、丸剂、散剂、膏剂等二十多类，收人他的医学巨著《千金翼方》中的方剂就有 2900余首。其中如独活寄生汤、续命汤、犀角地黄汤等许多方剂经久不衰，一直沿用至今。