唐贞观六年，孙思邈来到他的又一个主要隐居地——四川峨眉山，在这一带体察民情，行医采药。
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峨眉山重峦叠嶂，雄伟挺秀，千岩万壑，流云瀑布，素有“峨眉天下秀”之美誉，是我国古代佛教的四大名山之一。峨眉山中草药资源相当丰富，隋唐以前就有不少名医进山采药。唐贞观六年（公元632年），孙思邈告别长安，南下巴蜀，径直来到峨眉山。他经常荷锄拄杖，来往于群山丛中，并在周围的州县采药寻方，行医扶危，体察民情，考查医药。对于这一段的行踪，孙思邈在《备急千金要方》书中多有详实的记载，如：“贞观七年三月八日在内江” , “贞观十年在梓州”，同年还在“蜀县”，后来还到“玄武”等地……峨眉山是他继太白山之后的又一个主要隐居地，在他的医药学生涯里占有重要的位置。