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 温州医科大学是浙江省省属普通高等学校、浙江省重点建设高校。2015年成为浙江省人民政府、国家卫生计生委和教育部共建高校，2017年成为浙江省重点建设高校。学校现有临床医学、基础医学、药学、生物医学工程、医学技术一级学科博士点和临床医学专业学位博士点，临床医学、护理学、中药学、生物学、生物医学工程、基础医学、中西医结合、药学、医学技术、口腔医学、公共卫生与预防医学、公共管理等12个一级学科硕士点，临床医学、生物医学工程、口腔医学、护理、药学、公共卫生、应用心理等7个专业硕士学位授权点；设有临床医学和药学一级学科博士后科研流动站。学校位列ESI全国高校综合排名第69位，临床医学、药理学与毒理学、生物学与生物化学、分子生物学与遗传学、材料科学、化学、神经科学与行为学、免疫学、工程学等9个学科进入ESI全球排名前1%，其中临床医学专业进入ESI全球排名前1.032‰、药理学与毒理学进入前1.25‰。拥有1个国家工程技术研究中心、1个国家发改委工程研究中心、1个省部共建国家重点实验室、1 个国家临床医学研究中心（眼科疾病）、2个教育部省部共建协同创新中心、1个国家药监局重点实验室、2个国家级国际科技合作基地、1个国家级中医药平台、34个省部级科研平台。2个浙江省“重中之重一级学科”，3个浙江省A类一流学科、6个B类一流学科，10个浙江省高校重点学科，2个浙江省重点建设学科。

学校现有27个本科招生专业，2个“5+3 ”本硕一体化专业，1个临床医学中外合作办学专业。有在校本专科生15203人（全日制，不含独立学院——温州医科大学仁济学院），研究生6434人（含博士研究生472人），学历教育留学生606人。学校现有教职员工及医护人员14000余人（含附属医院），其中具有高级专业技术职务1800余人。学校本部现有专任教师1792人，其中具有正高级专业技术职务479人，具有副高级专业技术职务608人，博士学位1369人。有中国工程院院士1人、加拿大健康科学院院士2人、国家“杰青”项目获得者2人；一批优秀人才入选“国家万人”、科技部中青年科技创新领军人才、省特级专家等，一批教师获国家科技进步奖、光华工程科技奖、何梁何利基金科学与技术奖、全国优秀教师、全国师德标兵、全国三八红旗手等荣誉。拥有教育部创新团队1个、全国高校黄大年式教师团队2个、科技部高等学校学科创新引智基地（111基地）2个。学校获评省重才爱才先进单位。

学校承担国家级科研项目1400余项，科研成果获得省部级以上奖励190余项，其中获国家科技进步奖一等奖1项，国家科技进步奖二等奖5项，国家技术发明奖二等奖2项，教育部科技奖一等奖1项、二等奖3项，中华医学科技奖一等奖5项，中国药学会科技奖一等奖1项，浙江省科学技术奖重大贡献奖1项，浙江省科学技术奖一等奖21项，教育部人文社会科学优秀成果奖一二三等奖各1项，全国教育科学研究优秀成果奖二等奖1项，浙江省哲学社会科学优秀成果奖一等奖4项。学校拥有5所附属医院，其中4所为三级甲等医院，同时设有29所非直属附属医院（临床学院）。附属眼视光医院、附属第一医院、附属第二医院保持中国医院科技量值评价排行榜综合百强，附属眼视光医院稳居全国眼科专科医院第1名。