受害人陈述
我是一名快要开题的研二学生,入学来跟着师兄师姐也做了无数次的 PCR 实验了,怎么也算是经验颇丰了。
为了在开题报告里多放一些实验数据,最近从一大清早忙到半夜,一直跑 PCR,居然无一例外全都扑街了!
是试剂?引物?模板?还是有人要害我?亦或是传说中的 PCR 杀手作祟?
这太可怕了,你愿意跟我一层一层来揭秘吗?
第一次实验
消失的样品
像往常一样,我配置了一个 50uL 的 PCR 体系,设置的 PCR 程序为 2h,等跑完我拿出来一看,样品居然只剩下一半左右!这是合理的吗
?
(图片来源丁香实验)
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第二次实验
多出来的鬼影条带
因为害怕污染,所以实验中使用的试剂、水、引物都是新的。理论上讲,所有的东西应该很干净,最后却在凝胶电泳时,发现所有样品(包括阴性对照)里都出现了非特异条带!气得我疯狂掐人中,这个条带究竟从哪冒出来的啊?
(图片来源丁香实验)
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第三次实验
变成彗星的样品
我这次学聪明了,用了新的 PCR 管,终于没有污染的条带了。但我要的条带也没了!凝胶电泳后我的产物拖尾严重,我的样品离家出走了吗?
(图片来源丁香实验)
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第四次实验
断联的样品
配置了一大管 PCR 样品,分装成 5 管同时跑程序,结果核酸胶鉴定时发现五胞胎们有条带亮度不一致的,有条带干脆没有的。我可以报警吗?
(图片来源丁香实验)
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我们事无巨细地分析了一个个造成实验失败的可能原因,排除了一个个因素。最后发现了一个共性问题,即使可能性再小但真相或许就在这里:杀手可能就是隐藏在实验背后的 PCR 管!质量不过关的 PCR 管盖子如果盖不紧,会在加热时发生形变,导致外源异物或者核酸酶的污染,传热也会低效且不均匀。这罪状一桩桩列出来,罗翔老师看了都不敢做辩护
!
PCR 虽然是科研人常做的实验,但却也常常出错。由于体系内成分复杂,出现不理想的结果时排查起来非常麻烦,大多数只知道要考虑到引物、模板、外源污染和不正当操作的问题,殊不知不合格的 PCR 管也会给实验带来干扰。
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