(8.3)一键做好KEGG富集分析！

我们此前教大家傻瓜式做GSEA分析、GO分析等（点击查看）。今天给大家免费发送的资源是：

”基因功能预测之KEGG信号通路富集分析

（附万能代码及操作视频）“

如下即可免费获取：

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获取资源包之后，跟着我的步骤操作，你可以从从这样（根据基因的名字）：

得到一表三图（预测出基因的功能，并能知道具体是哪个分子在发挥作用，一表是指预测到的信号通路，三图是将结果可视化出来）：

多么高大上啊，赶快收藏本文，以后不论做实验还是发纯生信的SCI论文，都是非常需要的。”基因功能预测之KEGG信号通路富集分析（附万能代码及操作视频）“如下即可免费获取：

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好了，下面是具体的操作步骤：先看下面这个SCI论文，学会了KEGG富集分析，就学会了三分之一的SCI论文。KEGG富集分析就是看看基因与哪些通路相关（起到预测基因功能的作用），这样会给我们后续的研究提供很大的思路。

那么基因的KEGG信号通路富集分析怎么做的呢？话不多说，开始，傻瓜式万能代码，只要鼠标点点点就行。首先从我们这里领取资源后，资源包括三份文件和一份完整版操作视频（28分钟）：

大家可以看着视频操作，也可以看下面的步骤：

第一步、安装R软件：打开0、软件文件夹，双击安装即可。

第二步、基因的ID转换：打开1、ID转换文件夹，里面有symbol2id.R代码和symbol.txt，将symbol.txt里面的基因名和logFC换成你想做功能富集的基因名字和logFC值。

接着打开用Rstudio打开symbol2id.R代码，全选点击run后就会生成一个id文件：

第三步、KEGG信号通路富集分析：首先将刚才生成的id.txt文件复制粘贴到2、KEGG富集分析文件夹下，用Studio打开学霸资源宝库KEGG富集分析.R这个万能代码。一样，将代码全选，点击Run。

所以，这个时候很关键了，代码运行之前是这样的：只有id这个文件：

代码运行之后：就多了非常关键的一表三图：第一表：KEGG.txt。我们打开就知道哪些信号通路被富集。

第二、三图：富集总图。哪一条通路有多少基因富集，P值是多少，清清楚楚。同时也非常炫酷。

第四图：每一条通路的具体呈现图，如上我们得到了很多通路，然后我自己对Cell cycle这条通路感兴趣，那么，我们都点开它，就能看到每个基因在这个通路里面的哪个位置，红色是上调，绿色是下调。

这就是我们整理的傻瓜式万能代码。只要把基因名字一换，KEGG信号通路秒出来结果，分分钟感觉高大上。赶快把这个傻瓜式万能代码领取吧。免费哈👇👇👇。

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