(7.21)零代码纯生信复现一篇6.2分SCI论文，附详细步骤！

前言：

昨天我实操复现了一篇2区6.2分的SCI论文，效果很好。昨晚立刻就有同学按照我的步骤（非常详细）把SND1换成自己的基因（MYC）做了分析，而且还按照原文写了SCI，今晚就准备投出去。

祝贺该同学，所以大家赶快看着我非常详细的步骤先搞一篇SCI出来包毕业再说吧。如果要做实验的话，一篇2区6.2分的SCI论文需要花4年的博士时间+10万元的经费才能完成。

但是在医学学霸帮，只要1小时和0经费即可完成。对，你没有听错，就是1小时和0经费就可以完成，下面来跟着我一起复现吧↓↓↓。

正文：

下面这个就是发表的Genomics上2区6.2分的SCI纯生信论文，不用写代码，只要鼠标点点在线的数据库就可以出来结果。所以小编带着大家零基础重现一下这篇文章的每个图，也顺便学习一下各种工具的使用（每个步骤非常详细）。

（原文）

文献是非开放的，下不了，需要全文的同学可以在后台回复“721”获取全文！题目意思大概是：SND1基因在人肿瘤中致癌作用的泛癌分析。这篇文章就是说了SND1基因在肿瘤中的意义。那么，我们随便换一个基因，不要说发6分，至少也能发个3分的SCI。

而且，重现出一篇6分的SCI论文，再写出来，个人感觉也是能发2-3分的SCI。所以，赶快换成你自己的基因吧，先发一篇论文保证毕业再说呀。

注意：本操作步骤非常详细，一步一步实操，原文一共是6张图。因为篇幅有限，您可以看到前面三张图的实操步骤，剩下的三张图的实操步骤，请如下获取：

回复关键词：721

回复关键词：721

回复关键词：721

好了，下面正式开始重现每张图（一步一步跟着我的鼠标点点点哦）：

图1：

图1是介绍SND1基因的表达情况。

下面我们来拆分及重现：

拆分：图1a

作者通过TIMER2工具挖掘出TCGA数据库中SND1基因在各种癌症中的表达情况。

重现操作步骤：输入网址http://timer.cistrome.org/，打开TIMER2工具，如下操作，点击Submit之后就出来图了，再点击PDF下载下来就OK，跟文章一模一样的图就出来啦。

拆分：图1b

作者想表示出SND1在癌症组织和正常组织哪个表达更高。但是TCGA数据库没有DLBC 淋巴癌、GBMLGG 脑癌、SKCM 皮肤癌、TGCT 睾丸癌、THCA 甲状腺癌对应的正常组织，所以作者将TCGA与GTEx数据库联合进行分析。用的是GEPIA2工具（http://gepia2.cancer-pku.cn/#index）。

重现操作步骤：输入网址http://gepia2.cancer-pku.cn/#index，打开GEPIA2工具，如下操作就出图了，跟文章一模一样的图就出来啦。

拆分：图1c

作者明确了基因的表达水平，现在就要明确SND1的蛋白表达水平了。作者利用Ualcan工具（http://ualcan.path.uab.edu/index.html）挖掘TCGA数据库中SND1的蛋白表达水平。因为TCGA总共有7中肿瘤有蛋白数据，作者用了其中的6种。下面我只重复一种，都是一样的操作的。

重现操作步骤：输入网址http://ualcan.path.uab.edu/index.html，打开Ualcan工具，如下操作就出图了，跟文章一模一样的图就出来啦。

拆分：图1d

作者明确了基因的蛋白表达水平，现在就要明确SND1在不同肿瘤不同分期的表达水平。这里我也只示范一种肿瘤，其中肿瘤操作也是一样的。作者还是利用GEPIA2工具。

重现操作步骤：输入网址http://gepia2.cancer-pku.cn/#index，如下操作就出图啦：

图2：

图2是介绍SND1这个基因的预后情况

作者依然用的是GEPIA2工具，不多说。

重现操作步骤：输入网址http://gepia2.cancer-pku.cn/#index，如下操作就出图：第7步记得将文章中的肿瘤全部选上，我这里只选了4个作为演示。继而，明确了预后之后，我再以SND1在BLCA中的OS为例画单个基因的生存分析图（其他肿瘤的单基因生存分析也是一样的操作）。如下操作出图：

图3：

图3是介绍SND1这个基因变异情况

所用的工具是 cBioportal工具（网址:http://cbioportal.org）。下面来拆分及重现：

拆分：图3a

重现操作步骤：

这样，SND1这个基因在各种肿瘤中的变异情况图就出来了。这里作者去除了最后3个肿瘤类型,并对图片进行了修饰,大家可以下载pdf后用AI修饰（AI软件安装包在这里）。

拆分：图3b

重现操作步骤：

接着图3a的操作，下图中第二步点击p723这个位点可出现详细信息，得到了3例STAD和1例UCEC，跟原文中一样。

拆分：图3c

此图是作者体现该基因的3D结构图。

重现操作步骤：接着图3b的操作，如下点击3D，随后再如下图设置一下，原文中的图就出来了。

拆分：图3d

此图是基因变异的生存分析。作者做了SND1基因UCEC子宫内膜癌的overall survival（总生存率）、Disease-free survival（无病生存率），都是一样的操作，这里我以总生存率为例操作一下。

重现操作步骤：同样的，作者用的是cbioportal工具，如下操作：

这样我们就得到了原文中一模一样的图。原文中所有的图都能重现出来。这篇文章就是说了SND1这个基因在肿瘤中的意义。那么，我们随便换一个基因，不要说发6分，至少也能发个3分的SCI吧。

而且，重现出一篇6分的SCI论文，再写出来，个人感觉也是能发2-3分的SCI。所以，赶快换成你自己的基因吧。先发一篇论文保证毕业再说呀。

本原文有6张图，我复现此SCI论文的详细步骤一共是写了17页（已上传百度云）。因微信推文篇幅有限，重现6分SCI的实操详细操作步骤如下即可获取：

辛苦整理，全文未插入任何广告！

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