【直播】【热门研究与论文发表研讨会】牛津大学出版社 + 科研数据管理&发表策略

陈凤珍

嘉宾介绍：陈凤珍，国家基因库生命大数据平台数据应用负责人， 先后主导或参与《国家基因库序列归档系统》、《国家基因库大数据搜索系统》、《国家基因库大数据管理系统》、《国家基因库可信计算系统》、《单细胞数据库》、《病毒数据库》、《万种药用植物数据库》、《罕见病数据库》、《万种植物基因组数据库》、《千种昆虫数据库》等生物大数据平台或数据库建设。参与国家重点研发项目2项，省重点实验室1项，深圳市科创委学科布局课题1项。在国内外期刊发表论文7篇，发表软著/专利10个。作为主要起草人制定国家标准1项，深圳市地方标准1项，团体标准2项。其中国家标准获深圳市科学技术奖。发表论著1项。

摘要：组学测序已广泛应用于生物研究领域。在研究论文发表时，期刊一般要求将测序数据存储至公共数据库，因此用户面临如何选择第三方存储库进行数据开放共享，支持论文发表的问题。同时，在项目研究过程中，海量数据的产出也让项目组、实验室或企业面临着找数据难、用数据难、存数据难等严峻考验，给数据管理带来挑战。随着国内生命大数据平台的崛起，国内数据库逐步受到国际主流期刊的认可。为应对研究论文发表时数据开放共享问题，国家基因库构建了国家基因库序列归档系统（CNSA），CNSA是一个方便、快捷的归档组学数据的系统，支持原始测序、组装、变异、序列、单细胞、代谢等多种类型数据的提交。被多个国际期刊和出版集团指定为论文发表的第三方数据存储库；获得Wiley、Oxford、Cell Press、Hindawi出版集团和Cambridge、ACS、Microbiology Society出版社以及Science、PLOS、PeerJ系列期刊认可，符合SAGE期刊投稿需求；被全球性项目——地球生物基因组计划（Earth BioGenome Project，EBP）指定为数据存储库。并且递交到CNGBdb的数据统一进行DOI（数字对象标识符）标识，促进共享和利用。目前已汇集全国300多家高校科研单位约7PB的存储数据，面向科研人员开放共享，下载和利用。为应对研究过程中的数据管理挑战，追溯数据怎么来、到哪里去、如何使用，国家基因库搭建了数据管理系统 (CNGB-DM)，建立与国际INSDC组学数据标准兼容的组学数据归档和管理标准，形成项目、样本到数据全贯穿的数据追溯，致力于为企业，高校，医院和科研机构等提供数据管理服务。

编辑：黄琦

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